1996年，茅台酒工艺被确定为国家机密加以保护。2001年，茅台酒传统工艺列入首批物质文化遗产。2006年，批准将“茅台酒传统酿造工艺”列入首批非物质文化遗产名录，并申报世界非物质文化遗产。2001年3月29日，茅台酒被批准为“原产地域保护产品”。2013年3月28日，原国家质检总局批准调整“茅台酒”地理标志产品保护名称和保护范围。
茅台酒液纯净透明、醇馥幽郁的特点，是由酱香、窖底香、醇甜三大特殊风味融合而成，现已知香气组成成分多达300余种。茅台酒香气成分众多，有人赞誉“风味隔壁三家醉，雨后开瓶十里芳”。茅台酒香而不艳，在酿制过程中从不加半点香料，香气成分全是在反复发酵的过程中自然形成的。它的酒度一直稳定在52°—54°之间。
茅台酒以本地优质糯高梁为原料，用小麦制成高温曲，而用曲量多于原料。用曲多，发酵期长，多次发酵，多次取酒等独特工艺，这是茅台酒风格独特、品质优异的重要原因。酿制茅台酒要经过两次下料、九次蒸煮、八次摊晾加曲（发酵七次）、七次取酒，生产周期长达一年，再陈贮三年以上，勾兑调配，然后再贮存一年，使酒质更加和谐醇香，绵软柔和，方准装瓶出厂，全部生产过程近五年之久。
1997年，茅台推出款纪念酒——「香港回归1997」，至今正好25周年。纪念酒的开发为今天茅台的火热埋下了伏笔，开启了茅台收藏新时代。
2014年，白酒行业进入低谷。为了填补营收，茅台成立定制营销公司，开展个人、团体、企业等个性化定制业务。茅台生产过上千款产品，定制酒占据了大半壁江山。不过多数定制酒产量少、知名度不高，基本不流通；只有少数设计精美的定制纪念酒流入市场，深受藏家欢迎。
2019年，茅台酒市场价一路高涨，飞天一瓶难求。为保证飞天的供应量，官方取消了定制酒业务，砍掉了大部分非常规产品，纪念酒的开发也越来越谨慎。